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青霉素鉀溶解迅速,但是嚴禁靜脈推注,鉀進入血管速度過快會導致血鉀濃度迅速升高，血鉀升高會引起心臟驟停因肌肉注射很痛，同時，鉀離子對皮膚和血管有很強的剌激作用，同時靜脈推注過快會引起體內的血鉀過高，造成體內高血鉀癥，注射青霉素鉀疼痛感較強，用苯甲醇或利多卡因稀釋可以降低疼痛感。另外疼痛與下針部位和推藥速度都有關系。
青霉素鈉可以靜脈推注但是溶解困難,一般臨床上根據病情使用,可能引起水腫的疾病一般不用青霉素鈉,可能引起電解質紊亂的一般不用青霉素鉀,比如腎功能不好的或者有腦水腫的可以用青霉素鉀,而如果高鉀血癥的肯定要用青霉素鈉,也可以聯合用藥。
在藥物相互作用上.青霉素鈉與消膽胺合用時，可降低青霉素鈉的吸收。可能的機制是青霉素被消膽胺結合。與降膽寧合用時，青霉素鈉的血漿水平降低78%-79%，血漿濃度-時間曲線下面積(AUC)減少75%-85%。與氨甲蝶呤合用時，由于相互競爭腎小管分泌，可使氨甲蝶呤的腎臟清除率降低，增加氨甲蝶呤毒性，而青霉素鉀則不會有這些情況.
一般青霉素鉀稍貴于青霉素鈉，總體來說價格都還算比較便宜。